Protein–RNA interactions for Protein: Q13068

GAGE4, G antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE4Q13068 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GAGE4Q13068 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GAGE4Q13068 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms