Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.493e-7■□□□□ 10.3
GRSF1Q12849 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.513e-9■□□□□ 10.3
GRSF1Q12849 PDIA3-206ENST00000497349 739 ntTSL 25.17□□□□□ -1.583e-7■□□□□ 10.3
GRSF1Q12849 COPB2-210ENST00000512309 565 ntTSL 54.78□□□□□ -1.643e-9■□□□□ 10.3
GRSF1Q12849 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.42e-9■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.032e-9■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 SOD2-203ENST00000367055 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.662e-9■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 SOD2-216ENST00000546260 4302 ntTSL 510.36□□□□□ -0.752e-9■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.272e-9■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.41e-6■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 UNKL-207ENST00000403703 4281 ntTSL 1 (best)13.08□□□□□ -0.321e-6■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 NCL-202ENST00000356936 890 ntTSL 318.15■□□□□ 0.52e-25■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 NCL-207ENST00000461347 3967 ntTSL 214.01□□□□□ -0.172e-25■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-25■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 ITGB5-203ENST00000461306 577 ntTSL 411.78□□□□□ -0.521e-14■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 CAPRIN2-213ENST00000542550 770 ntTSL 327.76■■■□□ 2.031e-6■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 CAPRIN2-211ENST00000540584 569 ntTSL 424.34■■□□□ 1.491e-6■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 CAPRIN2-212ENST00000541765 630 ntTSL 522.81■■□□□ 1.241e-6■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 CAPRIN2-215ENST00000546129 501 ntTSL 422.51■■□□□ 1.191e-6■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 CAPRIN2-210ENST00000540436 557 ntTSL 321.09■□□□□ 0.971e-6■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 CAPRIN2-207ENST00000537108 2187 ntTSL 58.04□□□□□ -1.121e-6■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-22■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 DHCR24-203ENST00000535035 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.751e-22■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 NKD1-202ENST00000564336 477 ntTSL 323.87■■□□□ 1.411e-14■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.951e-14■□□□□ 10.2
GRSF1Q12849 ASGR1-207ENST00000574330 887 ntTSL 517.49■□□□□ 0.392e-13■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.962e-7■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.459e-7■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 PC-206ENST00000528224 1008 ntTSL 215.74■□□□□ 0.119e-7■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 PC-203ENST00000393960 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.839e-7■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 PC-202ENST00000393958 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.849e-7■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 PC-201ENST00000393955 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.99e-7■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 GLUL-210ENST00000484996 1369 ntTSL 321.45■■□□□ 1.023e-8■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.113e-8■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.043e-8■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.143e-8■□□□□ 10.1
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GRSF1Q12849 GLUL-212ENST00000491322 6132 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.793e-8■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 PSAT1-202ENST00000376588 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.653e-11■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.165e-7■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.145e-7■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 05e-7■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.262e-6■□□□□ 10.1
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GRSF1Q12849 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 WDR6-211ENST00000471162 3565 ntTSL 1 (best)12.71□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 WDR6-221ENST00000610967 4259 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 WDR6-208ENST00000452875 3916 ntTSL 1 (best)10.99□□□□□ -0.652e-6■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-6■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 SLC25A28-203ENST00000479722 581 ntTSL 215.28■□□□□ 0.046e-9■□□□□ 10.1
GRSF1Q12849 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.413e-6■□□□□ 10
GRSF1Q12849 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.063e-6■□□□□ 10
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GRSF1Q12849 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.346e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.416e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.546e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 NUMA1-220ENST00000541584 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.58□□□□□ -0.726e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 NUMA1-201ENST00000351960 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.896e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.066e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ACTB-203ENST00000417101 472 ntTSL 423.31■■□□□ 1.326e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ACTB-211ENST00000480301 657 ntTSL 1 (best)21.93■■□□□ 1.16e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ACTB-212ENST00000484841 1032 ntTSL 521.57■■□□□ 1.046e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ACTB-210ENST00000477812 820 ntTSL 220.45■□□□□ 0.866e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.776e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ACTB-205ENST00000432588 568 ntTSL 417.36■□□□□ 0.376e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.366e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ACTB-202ENST00000414620 561 ntTSL 416.56■□□□□ 0.246e-7■□□□□ 10
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GRSF1Q12849 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.236e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 516.47■□□□□ 0.236e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 416.41■□□□□ 0.226e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.16e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.16e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.026e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ZNF652-203ENST00000508237 4543 ntTSL 213.08□□□□□ -0.326e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ACTB-209ENST00000473257 556 ntTSL 312.06□□□□□ -0.486e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.286e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.352e-22■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.561e-7■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ZNF740-204ENST00000552593 966 ntTSL 326.58■■□□□ 1.852e-6■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.012e-6■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ZNF276-206ENST00000563983 3403 ntTSL 212.27□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 10
GRSF1Q12849 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.482e-6■□□□□ 10
GRSF1Q12849 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.232e-8■□□□□ 10
GRSF1Q12849 PPP6R2-206ENST00000427222 1811 ntTSL 517.65■□□□□ 0.423e-8■□□□□ 9.9
GRSF1Q12849 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.173e-8■□□□□ 9.9
GRSF1Q12849 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.213e-8■□□□□ 9.9
GRSF1Q12849 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.223e-8■□□□□ 9.9
GRSF1Q12849 PPP6R2-205ENST00000401672 2199 ntTSL 213.18□□□□□ -0.33e-8■□□□□ 9.9
GRSF1Q12849 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.473e-8■□□□□ 9.9
GRSF1Q12849 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.623e-8■□□□□ 9.9
GRSF1Q12849 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.173e-9■□□□□ 9.9
GRSF1Q12849 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.315e-6■□□□□ 9.9
GRSF1Q12849 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.245e-6■□□□□ 9.9
GRSF1Q12849 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.582e-6■□□□□ 9.9
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