RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564336.1

NKD1-202, Transcript of naked cuticle homolog 1, humanhuman

TSL 3

Gene NKD1, Length 477 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1-202ENST00000564336 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.04■■■■■ 6.56
NKD1-202ENST00000564336 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.95■■■■■ 5.59
NKD1-202ENST00000564336 ABCC9O60706 1549 aa49.54■■■■■ 5.52
NKD1-202ENST00000564336 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.28■■■■■ 5.16
NKD1-202ENST00000564336 NACADO15069 1562 aa47.12■■■■■ 5.13
NKD1-202ENST00000564336 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.01■■■■■ 5.12
NKD1-202ENST00000564336 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.68■■■■■ 5.06
NKD1-202ENST00000564336 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
NKD1-202ENST00000564336 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.36■■■■■ 5.01
NKD1-202ENST00000564336 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.28■■■■■ 5
NKD1-202ENST00000564336 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.27■■■■■ 5
NKD1-202ENST00000564336 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.22■■■■■ 4.99
NKD1-202ENST00000564336 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.07■■■■■ 4.97
NKD1-202ENST00000564336 SCRIBQ14160 1630 aa45.61■■■■■ 4.89
NKD1-202ENST00000564336 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.29■■■■■ 4.84
NKD1-202ENST00000564336 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
NKD1-202ENST00000564336 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.77■■■■■ 4.76
NKD1-202ENST00000564336 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.54■■■■■ 4.72
NKD1-202ENST00000564336 NCAPD3P42695 1498 aa43.57■■■■■ 4.57
NKD1-202ENST00000564336 SMARCA4P51532 1647 aa43.57■■■■■ 4.57
NKD1-202ENST00000564336 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.52■■■■■ 4.56
NKD1-202ENST00000564336 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
NKD1-202ENST00000564336 SMARCA2P51531 1590 aa43.32■■■■■ 4.52
NKD1-202ENST00000564336 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.24■■■■■ 4.51
NKD1-202ENST00000564336 HMGXB3Q12766 1538 aa43.22■■■■■ 4.51
NKD1-202ENST00000564336 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.16■■■■■ 4.5
NKD1-202ENST00000564336 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
NKD1-202ENST00000564336 NESP48681 1621 aa42.78■■■■■ 4.44
NKD1-202ENST00000564336 WIZO95785 1651 aa42.72■■■■■ 4.43
NKD1-202ENST00000564336 ERCC6Q03468 1493 aa42.61■■■■■ 4.41
NKD1-202ENST00000564336 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
NKD1-202ENST00000564336 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.42■■■■■ 4.38
NKD1-202ENST00000564336 CUX2O14529 1486 aa42.39■■■■■ 4.38
NKD1-202ENST00000564336 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.26■■■■■ 4.35
NKD1-202ENST00000564336 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.16■■■■■ 4.34
NKD1-202ENST00000564336 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
NKD1-202ENST00000564336 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
NKD1-202ENST00000564336 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.14■■■■■ 4.34
NKD1-202ENST00000564336 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.91■■■■■ 4.3
NKD1-202ENST00000564336 CFTRP13569 1480 aa41.9■■■■■ 4.3
NKD1-202ENST00000564336 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.79■■■■■ 4.28
NKD1-202ENST00000564336 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.75■■■■■ 4.27
NKD1-202ENST00000564336 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.74■■■■■ 4.27
NKD1-202ENST00000564336 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.69■■■■■ 4.26
NKD1-202ENST00000564336 WDR62O43379 1518 aa41.69■■■■■ 4.26
NKD1-202ENST00000564336 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.23
NKD1-202ENST00000564336 PRDM2Q13029 1718 aa41.43■■■■■ 4.22
NKD1-202ENST00000564336 TOPBP1Q92547 1522 aa41.04■■■■■ 4.16
NKD1-202ENST00000564336 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
NKD1-202ENST00000564336 ABCC8Q09428 1581 aa40.89■■■■■ 4.14
NKD1-202ENST00000564336 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.89■■■■■ 4.14
NKD1-202ENST00000564336 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
NKD1-202ENST00000564336 IFT140Q96RY7 1462 aa40.86■■■■■ 4.13
NKD1-202ENST00000564336 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
NKD1-202ENST00000564336 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
NKD1-202ENST00000564336 OSCARQ8IYS5 282 aa40.6■■■■■ 4.09
NKD1-202ENST00000564336 CUX1P39880 1505 aa40.57■■■■■ 4.09
NKD1-202ENST00000564336 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
NKD1-202ENST00000564336 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.55■■■■■ 4.08
NKD1-202ENST00000564336 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.54■■■■■ 4.082e-16■■■■□ 25.1
NKD1-202ENST00000564336 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.47■■■■■ 4.07
NKD1-202ENST00000564336 SOGA1O94964 1423 aa40.47■■■■■ 4.07
NKD1-202ENST00000564336 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
NKD1-202ENST00000564336 TRIM41Q8WV44 630 aa40.2■■■■■ 4.03
NKD1-202ENST00000564336 CHD1O14646 1710 aa40.18■■■■■ 4.02
NKD1-202ENST00000564336 WDR97A6NE52 1622 aa40.16■■■■■ 4.02
NKD1-202ENST00000564336 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.08■■■■■ 4.01
NKD1-202ENST00000564336 FBLN2P98095 1184 aa40.06■■■■■ 4
NKD1-202ENST00000564336 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.04■■■■■ 4
NKD1-202ENST00000564336 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.03■■■■■ 4
NKD1-202ENST00000564336 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.03■■■■■ 4
NKD1-202ENST00000564336 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.03■■■■■ 4
NKD1-202ENST00000564336 SYNJ1O43426 1573 aa40.02■■■■■ 4
NKD1-202ENST00000564336 GRIN2BQ13224 1484 aa40.02■■■■■ 4
NKD1-202ENST00000564336 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.02■■■■■ 4
NKD1-202ENST00000564336 TOP2BQ02880 1626 aa40■■■■□ 3.99
NKD1-202ENST00000564336 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40■■■■□ 3.99
NKD1-202ENST00000564336 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.97■■■■□ 3.99
NKD1-202ENST00000564336 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
NKD1-202ENST00000564336 ARHGEF11O15085 1522 aa39.95■■■■□ 3.99
NKD1-202ENST00000564336 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.93■■■■□ 3.98
NKD1-202ENST00000564336 PBRM1Q86U86 1689 aa39.89■■■■□ 3.98
NKD1-202ENST00000564336 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
NKD1-202ENST00000564336 SYNJ2O15056 1496 aa39.83■■■■□ 3.97
NKD1-202ENST00000564336 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.76■■■■□ 3.96
NKD1-202ENST00000564336 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.64■■■■□ 3.94
NKD1-202ENST00000564336 ARAP1Q96P48 1450 aa39.63■■■■□ 3.94
NKD1-202ENST00000564336 ADAMTS12P58397 1594 aa39.57■■■■□ 3.92
NKD1-202ENST00000564336 GRIN2AQ12879 1464 aa39.53■■■■□ 3.92
NKD1-202ENST00000564336 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.5■■■■□ 3.91
NKD1-202ENST00000564336 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.48■■■■□ 3.91
NKD1-202ENST00000564336 NUP160Q12769 1436 aa39.42■■■■□ 3.9
NKD1-202ENST00000564336 CEP170Q5SW79 1584 aa39.41■■■■□ 3.9
NKD1-202ENST00000564336 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.27■■■■□ 3.88
NKD1-202ENST00000564336 IGF1RP08069 1367 aa39.25■■■■□ 3.87
NKD1-202ENST00000564336 KIF27Q86VH2 1401 aa39.19■■■■□ 3.86
NKD1-202ENST00000564336 SHROOM2Q13796 1616 aa39.17■■■■□ 3.86
NKD1-202ENST00000564336 JPH4Q96JJ6 628 aa39.02■■■■□ 3.84
NKD1-202ENST00000564336 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.99■■■■□ 3.83
NKD1-202ENST00000564336 CUL7Q14999 1698 aa38.99■■■■□ 3.83
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