RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540584.1

CAPRIN2-211, Transcript of caprin family member 2, humanhuman

TSL 4

Gene CAPRIN2, Length 569 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2-211ENST00000540584 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.53■■■■■ 6.64
CAPRIN2-211ENST00000540584 ABCC9O60706 1549 aa51.06■■■■■ 5.76
CAPRIN2-211ENST00000540584 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.76■■■■■ 5.72
CAPRIN2-211ENST00000540584 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.48■■■■■ 5.35
CAPRIN2-211ENST00000540584 NACADO15069 1562 aa48.08■■■■■ 5.29
CAPRIN2-211ENST00000540584 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.07■■■■■ 5.29
CAPRIN2-211ENST00000540584 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.01■■■■■ 5.28
CAPRIN2-211ENST00000540584 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.57■■■■■ 5.21
CAPRIN2-211ENST00000540584 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.3■■■■■ 5.16
CAPRIN2-211ENST00000540584 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.29■■■■■ 5.16
CAPRIN2-211ENST00000540584 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.98■■■■■ 5.11
CAPRIN2-211ENST00000540584 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.77■■■■■ 5.08
CAPRIN2-211ENST00000540584 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.63■■■■■ 5.05
CAPRIN2-211ENST00000540584 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.34■■■■■ 5.01
CAPRIN2-211ENST00000540584 SCRIBQ14160 1630 aa46.33■■■■■ 5.01
CAPRIN2-211ENST00000540584 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.06■■■■■ 4.96
CAPRIN2-211ENST00000540584 CECR2Q9BXF3 1484 aa46■■■■■ 4.95
CAPRIN2-211ENST00000540584 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.91■■■■■ 4.94
CAPRIN2-211ENST00000540584 NCAPD3P42695 1498 aa44.38■■■■■ 4.69
CAPRIN2-211ENST00000540584 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.25■■■■■ 4.67
CAPRIN2-211ENST00000540584 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.23■■■■■ 4.67
CAPRIN2-211ENST00000540584 ERCC6Q03468 1493 aa44.15■■■■■ 4.66
CAPRIN2-211ENST00000540584 SMARCA4P51532 1647 aa44.13■■■■■ 4.66
CAPRIN2-211ENST00000540584 SMARCA2P51531 1590 aa44.12■■■■■ 4.65
CAPRIN2-211ENST00000540584 CUX2O14529 1486 aa44.03■■■■■ 4.64
CAPRIN2-211ENST00000540584 HMGXB3Q12766 1538 aa44.01■■■■■ 4.64
CAPRIN2-211ENST00000540584 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
CAPRIN2-211ENST00000540584 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
CAPRIN2-211ENST00000540584 NESP48681 1621 aa43.77■■■■■ 4.6
CAPRIN2-211ENST00000540584 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.65■■■■■ 4.58
CAPRIN2-211ENST00000540584 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.56■■■■■ 4.56
CAPRIN2-211ENST00000540584 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.42■■■■■ 4.54
CAPRIN2-211ENST00000540584 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
CAPRIN2-211ENST00000540584 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.25■■■■■ 4.51
CAPRIN2-211ENST00000540584 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.18■■■■■ 4.5
CAPRIN2-211ENST00000540584 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.07■■■■■ 4.49
CAPRIN2-211ENST00000540584 WIZO95785 1651 aa43.05■■■■■ 4.48
CAPRIN2-211ENST00000540584 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.84■■■■■ 4.45
CAPRIN2-211ENST00000540584 WDR62O43379 1518 aa42.69■■■■■ 4.42
CAPRIN2-211ENST00000540584 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.66■■■■■ 4.42
CAPRIN2-211ENST00000540584 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.6■■■■■ 4.41
CAPRIN2-211ENST00000540584 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.59■■■■■ 4.41
CAPRIN2-211ENST00000540584 CFTRP13569 1480 aa42.49■■■■■ 4.39
CAPRIN2-211ENST00000540584 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
CAPRIN2-211ENST00000540584 TRIM41Q8WV44 630 aa42.38■■■■■ 4.37
CAPRIN2-211ENST00000540584 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
CAPRIN2-211ENST00000540584 OSCARQ8IYS5 282 aa42.11■■■■■ 4.33
CAPRIN2-211ENST00000540584 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.04■■■■■ 4.32
CAPRIN2-211ENST00000540584 PRDM2Q13029 1718 aa42.03■■■■■ 4.32
CAPRIN2-211ENST00000540584 IFT140Q96RY7 1462 aa41.8■■■■■ 4.28
CAPRIN2-211ENST00000540584 TOPBP1Q92547 1522 aa41.74■■■■■ 4.27
CAPRIN2-211ENST00000540584 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
CAPRIN2-211ENST00000540584 ABCC8Q09428 1581 aa41.67■■■■■ 4.26
CAPRIN2-211ENST00000540584 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.56■■■■■ 4.24
CAPRIN2-211ENST00000540584 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
CAPRIN2-211ENST00000540584 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.47■■■■■ 4.23
CAPRIN2-211ENST00000540584 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.47■■■■■ 4.23
CAPRIN2-211ENST00000540584 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.47■■■■■ 4.23
CAPRIN2-211ENST00000540584 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.38■■■■■ 4.211e-6■□□□□ 9.3
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CAPRIN2-211ENST00000540584 ARHGEF11O15085 1522 aa41.32■■■■■ 4.2
CAPRIN2-211ENST00000540584 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
CAPRIN2-211ENST00000540584 FBLN2P98095 1184 aa41.29■■■■■ 4.2
CAPRIN2-211ENST00000540584 CHD1O14646 1710 aa41.21■■■■■ 4.19
CAPRIN2-211ENST00000540584 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.19■■■■■ 4.18
CAPRIN2-211ENST00000540584 SOGA1O94964 1423 aa41.18■■■■■ 4.18
CAPRIN2-211ENST00000540584 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.16■■■■■ 4.18
CAPRIN2-211ENST00000540584 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
CAPRIN2-211ENST00000540584 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.03■■■■■ 4.16
CAPRIN2-211ENST00000540584 CUX1P39880 1505 aa40.93■■■■■ 4.14
CAPRIN2-211ENST00000540584 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.93■■■■■ 4.14
CAPRIN2-211ENST00000540584 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
CAPRIN2-211ENST00000540584 WDR97A6NE52 1622 aa40.91■■■■■ 4.14
CAPRIN2-211ENST00000540584 ARAP1Q96P48 1450 aa40.89■■■■■ 4.14
CAPRIN2-211ENST00000540584 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
CAPRIN2-211ENST00000540584 GRIN2BQ13224 1484 aa40.8■■■■■ 4.12
CAPRIN2-211ENST00000540584 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
CAPRIN2-211ENST00000540584 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
CAPRIN2-211ENST00000540584 SYNJ1O43426 1573 aa40.74■■■■■ 4.11
CAPRIN2-211ENST00000540584 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.69■■■■■ 4.1
CAPRIN2-211ENST00000540584 SYNJ2O15056 1496 aa40.68■■■■■ 4.1
CAPRIN2-211ENST00000540584 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.64■■■■■ 4.1
CAPRIN2-211ENST00000540584 PBRM1Q86U86 1689 aa40.59■■■■■ 4.09
CAPRIN2-211ENST00000540584 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.52■■■■■ 4.08
CAPRIN2-211ENST00000540584 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.45■■■■■ 4.07
CAPRIN2-211ENST00000540584 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.4■■■■■ 4.06
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CAPRIN2-211ENST00000540584 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.21■■■■■ 4.03
CAPRIN2-211ENST00000540584 ADAMTS12P58397 1594 aa40.18■■■■■ 4.02
CAPRIN2-211ENST00000540584 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.11■■■■■ 4.01
CAPRIN2-211ENST00000540584 CEP170Q5SW79 1584 aa40.1■■■■■ 4.01
CAPRIN2-211ENST00000540584 NUP160Q12769 1436 aa40.09■■■■■ 4.01
CAPRIN2-211ENST00000540584 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.08■■■■■ 4.01
CAPRIN2-211ENST00000540584 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.02■■■■■ 4
CAPRIN2-211ENST00000540584 SHROOM2Q13796 1616 aa39.91■■■■□ 3.98
CAPRIN2-211ENST00000540584 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
CAPRIN2-211ENST00000540584 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
CAPRIN2-211ENST00000540584 JPH4Q96JJ6 628 aa39.8■■■■□ 3.96
CAPRIN2-211ENST00000540584 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.6■■■■□ 3.93
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