Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIRE1Q08AE8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.4 ms