Protein–RNA interactions for Protein: Q06330

RBPJ, Recombining binding protein suppressor of hairless, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBPJQ06330 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBPJQ06330 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBPJQ06330 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms