Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APBA1Q02410 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBA1Q02410 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBA1Q02410 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms