Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS35P82673 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS35P82673 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms