Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHC1P78364 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHC1P78364 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHC1P78364 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHC1P78364 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHC1P78364 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHC1P78364 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHC1P78364 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHC1P78364 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHC1P78364 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHC1P78364 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHC1P78364 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHC1P78364 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHC1P78364 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHC1P78364 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHC1P78364 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHC1P78364 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHC1P78364 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHC1P78364 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHC1P78364 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHC1P78364 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PHC1P78364 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHC1P78364 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHC1P78364 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHC1P78364 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHC1P78364 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHC1P78364 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHC1P78364 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHC1P78364 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHC1P78364 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHC1P78364 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHC1P78364 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHC1P78364 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHC1P78364 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHC1P78364 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHC1P78364 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHC1P78364 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHC1P78364 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHC1P78364 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHC1P78364 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHC1P78364 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHC1P78364 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHC1P78364 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHC1P78364 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHC1P78364 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHC1P78364 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHC1P78364 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHC1P78364 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHC1P78364 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHC1P78364 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHC1P78364 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHC1P78364 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHC1P78364 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHC1P78364 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHC1P78364 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHC1P78364 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHC1P78364 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHC1P78364 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHC1P78364 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHC1P78364 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHC1P78364 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHC1P78364 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHC1P78364 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHC1P78364 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHC1P78364 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHC1P78364 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHC1P78364 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHC1P78364 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHC1P78364 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms