Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UTRNP46939 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UTRNP46939 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UTRNP46939 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UTRNP46939 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UTRNP46939 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UTRNP46939 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UTRNP46939 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UTRNP46939 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UTRNP46939 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UTRNP46939 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UTRNP46939 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UTRNP46939 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UTRNP46939 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UTRNP46939 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
UTRNP46939 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UTRNP46939 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
UTRNP46939 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UTRNP46939 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UTRNP46939 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UTRNP46939 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UTRNP46939 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UTRNP46939 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UTRNP46939 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UTRNP46939 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UTRNP46939 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UTRNP46939 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UTRNP46939 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UTRNP46939 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UTRNP46939 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
UTRNP46939 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UTRNP46939 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UTRNP46939 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UTRNP46939 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UTRNP46939 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UTRNP46939 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
UTRNP46939 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UTRNP46939 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UTRNP46939 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UTRNP46939 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UTRNP46939 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UTRNP46939 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UTRNP46939 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UTRNP46939 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UTRNP46939 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UTRNP46939 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UTRNP46939 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UTRNP46939 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
UTRNP46939 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
UTRNP46939 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UTRNP46939 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UTRNP46939 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UTRNP46939 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UTRNP46939 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UTRNP46939 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
UTRNP46939 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UTRNP46939 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
UTRNP46939 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
UTRNP46939 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UTRNP46939 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UTRNP46939 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UTRNP46939 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
UTRNP46939 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UTRNP46939 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UTRNP46939 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UTRNP46939 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UTRNP46939 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UTRNP46939 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UTRNP46939 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UTRNP46939 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UTRNP46939 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UTRNP46939 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UTRNP46939 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UTRNP46939 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
UTRNP46939 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
UTRNP46939 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UTRNP46939 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UTRNP46939 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UTRNP46939 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UTRNP46939 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UTRNP46939 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UTRNP46939 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UTRNP46939 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UTRNP46939 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UTRNP46939 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UTRNP46939 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
UTRNP46939 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UTRNP46939 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UTRNP46939 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UTRNP46939 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UTRNP46939 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
UTRNP46939 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
UTRNP46939 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UTRNP46939 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UTRNP46939 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UTRNP46939 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UTRNP46939 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UTRNP46939 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UTRNP46939 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UTRNP46939 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms