Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP2P42575 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP2P42575 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP2P42575 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP2P42575 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP2P42575 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP2P42575 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP2P42575 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP2P42575 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP2P42575 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP2P42575 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP2P42575 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP2P42575 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP2P42575 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP2P42575 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP2P42575 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP2P42575 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP2P42575 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP2P42575 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP2P42575 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP2P42575 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP2P42575 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP2P42575 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP2P42575 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP2P42575 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP2P42575 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP2P42575 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP2P42575 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP2P42575 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP2P42575 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP2P42575 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP2P42575 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP2P42575 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP2P42575 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP2P42575 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP2P42575 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP2P42575 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP2P42575 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP2P42575 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP2P42575 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP2P42575 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP2P42575 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP2P42575 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP2P42575 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP2P42575 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP2P42575 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP2P42575 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP2P42575 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP2P42575 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP2P42575 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP2P42575 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP2P42575 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP2P42575 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP2P42575 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP2P42575 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP2P42575 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP2P42575 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP2P42575 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP2P42575 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP2P42575 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP2P42575 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP2P42575 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP2P42575 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP2P42575 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP2P42575 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP2P42575 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP2P42575 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP2P42575 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.1 ms