Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 U2SURP-212ENST00000488587 866 ntTSL 31.78□□□□□ -2.121e-11■■■■■ 31
U2AF2P26368 IMPA1-211ENST00000522997 770 ntTSL 59.2□□□□□ -0.949e-8■■■■■ 31
U2AF2P26368 IMPA1-207ENST00000519964 653 ntTSL 38.77□□□□□ -1.019e-8■■■■■ 31
U2AF2P26368 IMPA1-205ENST00000518202 627 ntTSL 46.96□□□□□ -1.39e-8■■■■■ 31
U2AF2P26368 IMPA1-210ENST00000521979 566 ntTSL 46.34□□□□□ -1.399e-8■■■■■ 31
U2AF2P26368 IMPA1-209ENST00000521360 543 ntTSL 56.34□□□□□ -1.399e-8■■■■■ 31
U2AF2P26368 IMPA1-206ENST00000519816 617 ntTSL 35.52□□□□□ -1.539e-8■■■■■ 31
U2AF2P26368 PUS7L-202ENST00000416848 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.382e-8■■■■■ 31
U2AF2P26368 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.512e-8■■■■■ 31
U2AF2P26368 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.562e-8■■■■■ 31
U2AF2P26368 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.592e-8■■■■■ 31
U2AF2P26368 GTPBP2-203ENST00000419497 1394 ntTSL 217.71■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 31
U2AF2P26368 GTPBP2-204ENST00000432918 1850 ntTSL 314.59□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 31
U2AF2P26368 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.627e-9■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 METAP2-204ENST00000546478 232 ntTSL 21.34□□□□□ -2.196e-7■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 ATG16L2-219ENST00000542908 1178 ntTSL 225.34■■□□□ 1.654e-12■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 PKP4-211ENST00000481115 884 ntTSL 58.54□□□□□ -1.041e-8■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.175e-17■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.445e-17■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.165e-17■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 ADARB1-215ENST00000631642 301 ntTSL 56.38□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.462e-10■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 UCK2-208ENST00000479872 4669 ntTSL 29.56□□□□□ -0.882e-10■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.142e-10■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 UCK2-204ENST00000464197 811 ntTSL 47.52□□□□□ -1.212e-10■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.252e-10■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 UCK2-203ENST00000463772 599 ntTSL 57.09□□□□□ -1.272e-10■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 UCK2-202ENST00000462329 830 ntTSL 1 (best)6.6□□□□□ -1.352e-10■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 ARHGAP21-207ENST00000446003 3859 ntTSL 1 (best)14.02□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 ARHGAP21-211ENST00000476499 1612 ntTSL 213.35□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 ARHGAP21-219ENST00000636842 551 ntTSL 52.1□□□□□ -2.071e-7■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 ARHGAP21-204ENST00000416305 801 ntTSL 51.78□□□□□ -2.121e-7■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 GCKR-204ENST00000453813 701 ntTSL 316.28■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 GCKR-203ENST00000417872 568 ntTSL 415.17■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.332e-9■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.922e-9■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 TAF15-203ENST00000603393 1214 ntTSL 1 (best)19.69■□□□□ 0.742e-9■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.522e-9■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 TAF15-212ENST00000604879 808 ntTSL 515.48■□□□□ 0.072e-9■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 TAF15-201ENST00000603067 580 ntTSL 56.93□□□□□ -1.32e-9■■■■■ 30.9
U2AF2P26368 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.951e-7■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 ACAP2-215ENST00000618471 3207 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 KATNBL1-211ENST00000560247 1708 ntTSL 1 (best)21.25■□□□□ 0.994e-7■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 KATNBL1-202ENST00000540594 1267 ntTSL 220.59■□□□□ 0.894e-7■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 MTAP-211ENST00000581962 323 ntTSL 26.46□□□□□ -1.387e-7■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 KATNBL1-209ENST00000559760 733 ntTSL 54.32□□□□□ -1.724e-7■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 MTAP-205ENST00000484957 399 ntTSL 31.55□□□□□ -2.167e-7■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 LARP1B-209ENST00000508819 1891 ntTSL 58.49□□□□□ -1.054e-7■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.755e-12■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 POLN-213ENST00000515357 2183 ntTSL 225.12■■□□□ 1.615e-12■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 HAUS3-205ENST00000514395 580 ntTSL 424.39■■□□□ 1.495e-12■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 HAUS3-203ENST00000502440 574 ntTSL 421.58■■□□□ 1.055e-12■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.585e-12■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.35e-12■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.385e-12■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 TTLL4-211ENST00000448224 583 ntTSL 511.42□□□□□ -0.587e-19■■■■■ 30.8
U2AF2P26368 NOP2-208ENST00000537708 598 ntTSL 417.86■□□□□ 0.457e-26■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.397e-26■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NOP2-217ENST00000544630 657 ntTSL 317.47■□□□□ 0.397e-26■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NOP2-213ENST00000542015 1002 ntTSL 317.18■□□□□ 0.347e-26■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.077e-26■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NOP2-201ENST00000322166 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.167e-26■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NOP2-203ENST00000399466 2701 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.187e-26■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NOP2-223ENST00000620535 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.277e-26■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NOP2-207ENST00000537442 2613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.437e-26■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NOP2-218ENST00000545200 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.467e-26■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NOP2-202ENST00000382421 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.497e-26■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NOP2-206ENST00000536506 889 ntTSL 510.93□□□□□ -0.667e-26■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 ZFR-204ENST00000505366 1159 ntTSL 1 (best)18.67■□□□□ 0.584e-15■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.134e-15■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.634e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.224e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.094e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.884e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.824e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.771e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CAPN10-206ENST00000391983 2320 ntTSL 1 (best)26.12■■□□□ 1.774e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.634e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CAPN10-201ENST00000270361 2453 ntTSL 1 (best)24.82■■□□□ 1.564e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 AL031686.1-202ENST00000639819 1995 ntTSL 524.76■■□□□ 1.554e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.494e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.454e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CAPN10-209ENST00000416591 2514 ntTSL 1 (best)24.07■■□□□ 1.444e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 STXBP1-214ENST00000635950 2771 ntTSL 524.02■■□□□ 1.444e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.331e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.264e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CAPN10-205ENST00000357048 2202 ntTSL 1 (best)22.74■■□□□ 1.234e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.224e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SNX17-202ENST00000427123 2007 ntTSL 222.31■■□□□ 1.164e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SNX17-203ENST00000440760 1955 ntTSL 1 (best)22.03■■□□□ 1.124e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.084e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.064e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.054e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.034e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.024e-7■■■■■ 30.7
U2AF2P26368 STXBP1-213ENST00000630492 572 ntTSL 521.28■■□□□ 14e-7■■■■■ 30.7
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 1161.9 ms