RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515357.5

POLN-213, Transcript of DNA polymerase nu, humanhuman

TSL 2

Gene POLN, Length 2,183 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLN-213ENST00000515357 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.88■■■■■ 5.26
POLN-213ENST00000515357 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.37■■■■■ 4.21
POLN-213ENST00000515357 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
POLN-213ENST00000515357 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.67■■■■□ 3.94
POLN-213ENST00000515357 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.53■■■■□ 3.92
POLN-213ENST00000515357 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.47■■■■□ 3.91
POLN-213ENST00000515357 ABCC9O60706 1549 aa38.87■■■■□ 3.81
POLN-213ENST00000515357 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.77■■■■□ 3.8
POLN-213ENST00000515357 NACADO15069 1562 aa38.43■■■■□ 3.74
POLN-213ENST00000515357 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
POLN-213ENST00000515357 SCRIBQ14160 1630 aa38.32■■■■□ 3.73
POLN-213ENST00000515357 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.98■■■■□ 3.67
POLN-213ENST00000515357 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
POLN-213ENST00000515357 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.4■■■■□ 3.58
POLN-213ENST00000515357 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.3■■■■□ 3.56
POLN-213ENST00000515357 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.1■■■■□ 3.53
POLN-213ENST00000515357 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.99■■■■□ 3.51
POLN-213ENST00000515357 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.98■■■■□ 3.51
POLN-213ENST00000515357 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
POLN-213ENST00000515357 WIZO95785 1651 aa36.84■■■■□ 3.49
POLN-213ENST00000515357 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.84■■■■□ 3.49
POLN-213ENST00000515357 SMARCA4P51532 1647 aa36.7■■■■□ 3.47
POLN-213ENST00000515357 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
POLN-213ENST00000515357 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.17■■■■□ 3.38
POLN-213ENST00000515357 SMARCA2P51531 1590 aa36.09■■■■□ 3.37
POLN-213ENST00000515357 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.07■■■■□ 3.37
POLN-213ENST00000515357 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
POLN-213ENST00000515357 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.98■■■■□ 3.35
POLN-213ENST00000515357 TRIM41Q8WV44 630 aa35.95■■■■□ 3.34
POLN-213ENST00000515357 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
POLN-213ENST00000515357 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.71■■■■□ 3.31
POLN-213ENST00000515357 ABCC8Q09428 1581 aa35.57■■■■□ 3.28
POLN-213ENST00000515357 NCAPD3P42695 1498 aa35.52■■■■□ 3.28
POLN-213ENST00000515357 HMGXB3Q12766 1538 aa35.48■■■■□ 3.27
POLN-213ENST00000515357 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
POLN-213ENST00000515357 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.16■■■■□ 3.22
POLN-213ENST00000515357 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.14■■■■□ 3.22
POLN-213ENST00000515357 SYNJ1O43426 1573 aa35.06■■■■□ 3.2
POLN-213ENST00000515357 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.03■■■■□ 3.2
POLN-213ENST00000515357 SOGA1O94964 1423 aa35.01■■■■□ 3.2
POLN-213ENST00000515357 CFTRP13569 1480 aa34.92■■■■□ 3.18
POLN-213ENST00000515357 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.89■■■■□ 3.18
POLN-213ENST00000515357 EEA1Q15075 1411 aa34.81■■■■□ 3.16
POLN-213ENST00000515357 TOP2BQ02880 1626 aa34.79■■■■□ 3.16
POLN-213ENST00000515357 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.72■■■■□ 3.15
POLN-213ENST00000515357 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.71■■■■□ 3.15
POLN-213ENST00000515357 PRDM2Q13029 1718 aa34.7■■■■□ 3.15
POLN-213ENST00000515357 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.68■■■■□ 3.14
POLN-213ENST00000515357 CUX1P39880 1505 aa34.64■■■■□ 3.14
POLN-213ENST00000515357 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.59■■■■□ 3.13
POLN-213ENST00000515357 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.46■■■■□ 3.11
POLN-213ENST00000515357 GOLGA3Q08378 1498 aa34.44■■■■□ 3.1
POLN-213ENST00000515357 KIF21BO75037 1637 aa34.41■■■■□ 3.1
POLN-213ENST00000515357 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.38■■■■□ 3.09
POLN-213ENST00000515357 CEP162Q5TB80 1403 aa34.38■■■■□ 3.09
POLN-213ENST00000515357 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
POLN-213ENST00000515357 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.35■■■■□ 3.09
POLN-213ENST00000515357 NESP48681 1621 aa34.34■■■■□ 3.09
POLN-213ENST00000515357 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.33■■■■□ 3.09
POLN-213ENST00000515357 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
POLN-213ENST00000515357 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.24■■■■□ 3.07
POLN-213ENST00000515357 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.19■■■■□ 3.06
POLN-213ENST00000515357 KIF27Q86VH2 1401 aa34.18■■■■□ 3.06
POLN-213ENST00000515357 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.15■■■■□ 3.06
POLN-213ENST00000515357 PRXQ9BXM0 1461 aa34.13■■■■□ 3.05
POLN-213ENST00000515357 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.06■■■■□ 3.04
POLN-213ENST00000515357 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.06■■■■□ 3.04
POLN-213ENST00000515357 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
POLN-213ENST00000515357 CUX2O14529 1486 aa34.03■■■■□ 3.04
POLN-213ENST00000515357 TOPBP1Q92547 1522 aa34.02■■■■□ 3.04
POLN-213ENST00000515357 HRCP23327 699 aa33.96■■■■□ 3.03
POLN-213ENST00000515357 CLIP1P30622 1438 aa33.96■■■■□ 3.03
POLN-213ENST00000515357 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
POLN-213ENST00000515357 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.91■■■■□ 3.02
POLN-213ENST00000515357 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
POLN-213ENST00000515357 IGF1RP08069 1367 aa33.9■■■■□ 3.02
POLN-213ENST00000515357 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.87■■■■□ 3.01
POLN-213ENST00000515357 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.85■■■■□ 3.01
POLN-213ENST00000515357 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.81■■■■□ 3
POLN-213ENST00000515357 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
POLN-213ENST00000515357 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.73■■■□□ 2.99
POLN-213ENST00000515357 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.71■■■□□ 2.99
POLN-213ENST00000515357 WDR97A6NE52 1622 aa33.66■■■□□ 2.98
POLN-213ENST00000515357 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
POLN-213ENST00000515357 ARAP1Q96P48 1450 aa33.6■■■□□ 2.97
POLN-213ENST00000515357 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.51■■■□□ 2.95
POLN-213ENST00000515357 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
POLN-213ENST00000515357 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.49■■■□□ 2.95
POLN-213ENST00000515357 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.47■■■□□ 2.95
POLN-213ENST00000515357 CUL7Q14999 1698 aa33.47■■■□□ 2.95
POLN-213ENST00000515357 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
POLN-213ENST00000515357 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.42■■■□□ 2.94
POLN-213ENST00000515357 APLP2Q06481 763 aa33.34■■■□□ 2.93
POLN-213ENST00000515357 WDR62O43379 1518 aa33.29■■■□□ 2.92
POLN-213ENST00000515357 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.22■■■□□ 2.91
POLN-213ENST00000515357 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.19■■■□□ 2.95e-9■■■■■ 31
POLN-213ENST00000515357 ERCC6Q03468 1493 aa33.18■■■□□ 2.9
POLN-213ENST00000515357 PBRM1Q86U86 1689 aa33.18■■■□□ 2.9
POLN-213ENST00000515357 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
POLN-213ENST00000515357 IFT140Q96RY7 1462 aa33.13■■■□□ 2.89
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