Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB1P16220 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB1P16220 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB1P16220 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB1P16220 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB1P16220 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB1P16220 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB1P16220 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB1P16220 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB1P16220 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB1P16220 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB1P16220 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB1P16220 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB1P16220 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB1P16220 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB1P16220 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB1P16220 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB1P16220 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB1P16220 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB1P16220 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB1P16220 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB1P16220 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB1P16220 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB1P16220 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB1P16220 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB1P16220 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB1P16220 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB1P16220 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB1P16220 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB1P16220 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB1P16220 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB1P16220 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CREB1P16220 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB1P16220 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB1P16220 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB1P16220 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB1P16220 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB1P16220 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB1P16220 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB1P16220 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB1P16220 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB1P16220 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB1P16220 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB1P16220 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB1P16220 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB1P16220 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB1P16220 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB1P16220 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB1P16220 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB1P16220 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB1P16220 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB1P16220 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB1P16220 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB1P16220 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB1P16220 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB1P16220 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB1P16220 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB1P16220 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB1P16220 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB1P16220 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB1P16220 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB1P16220 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB1P16220 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB1P16220 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB1P16220 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB1P16220 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB1P16220 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB1P16220 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB1P16220 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB1P16220 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB1P16220 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB1P16220 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB1P16220 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB1P16220 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB1P16220 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB1P16220 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB1P16220 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB1P16220 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB1P16220 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB1P16220 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB1P16220 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB1P16220 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB1P16220 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB1P16220 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB1P16220 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CREB1P16220 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CREB1P16220 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB1P16220 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB1P16220 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB1P16220 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB1P16220 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB1P16220 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB1P16220 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB1P16220 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB1P16220 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB1P16220 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB1P16220 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB1P16220 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB1P16220 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB1P16220 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms