Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00271P0C7V0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms