Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOCP08134 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOCP08134 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOCP08134 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOCP08134 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOCP08134 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOCP08134 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOCP08134 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOCP08134 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOCP08134 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOCP08134 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOCP08134 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOCP08134 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOCP08134 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOCP08134 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOCP08134 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOCP08134 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOCP08134 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOCP08134 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOCP08134 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOCP08134 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOCP08134 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOCP08134 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOCP08134 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOCP08134 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOCP08134 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOCP08134 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOCP08134 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOCP08134 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOCP08134 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOCP08134 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOCP08134 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOCP08134 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOCP08134 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOCP08134 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOCP08134 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOCP08134 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOCP08134 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOCP08134 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOCP08134 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOCP08134 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOCP08134 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOCP08134 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOCP08134 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOCP08134 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOCP08134 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOCP08134 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOCP08134 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOCP08134 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOCP08134 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOCP08134 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOCP08134 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOCP08134 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOCP08134 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOCP08134 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOCP08134 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOCP08134 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOCP08134 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOCP08134 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOCP08134 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOCP08134 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOCP08134 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOCP08134 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOCP08134 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOCP08134 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOCP08134 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOCP08134 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOCP08134 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOCP08134 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOCP08134 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOCP08134 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOCP08134 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOCP08134 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOCP08134 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOCP08134 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOCP08134 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOCP08134 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOCP08134 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOCP08134 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOCP08134 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOCP08134 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOCP08134 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOCP08134 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOCP08134 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOCP08134 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOCP08134 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOCP08134 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOCP08134 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOCP08134 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOCP08134 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOCP08134 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOCP08134 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOCP08134 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOCP08134 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOCP08134 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOCP08134 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOCP08134 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOCP08134 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOCP08134 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOCP08134 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms