Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRNPP04156 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRNPP04156 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRNPP04156 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRNPP04156 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRNPP04156 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRNPP04156 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRNPP04156 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRNPP04156 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRNPP04156 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRNPP04156 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRNPP04156 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRNPP04156 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRNPP04156 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRNPP04156 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRNPP04156 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRNPP04156 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRNPP04156 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRNPP04156 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRNPP04156 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRNPP04156 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRNPP04156 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRNPP04156 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRNPP04156 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRNPP04156 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRNPP04156 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRNPP04156 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRNPP04156 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRNPP04156 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRNPP04156 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRNPP04156 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRNPP04156 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRNPP04156 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRNPP04156 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRNPP04156 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRNPP04156 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRNPP04156 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRNPP04156 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRNPP04156 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRNPP04156 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRNPP04156 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRNPP04156 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRNPP04156 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRNPP04156 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRNPP04156 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRNPP04156 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRNPP04156 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRNPP04156 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRNPP04156 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRNPP04156 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRNPP04156 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRNPP04156 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRNPP04156 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRNPP04156 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRNPP04156 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRNPP04156 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRNPP04156 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRNPP04156 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRNPP04156 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRNPP04156 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRNPP04156 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRNPP04156 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRNPP04156 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRNPP04156 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRNPP04156 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRNPP04156 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRNPP04156 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRNPP04156 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRNPP04156 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRNPP04156 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRNPP04156 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRNPP04156 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRNPP04156 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRNPP04156 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRNPP04156 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRNPP04156 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRNPP04156 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRNPP04156 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRNPP04156 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRNPP04156 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRNPP04156 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRNPP04156 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRNPP04156 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRNPP04156 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRNPP04156 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRNPP04156 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRNPP04156 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRNPP04156 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRNPP04156 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRNPP04156 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRNPP04156 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRNPP04156 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRNPP04156 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRNPP04156 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRNPP04156 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRNPP04156 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRNPP04156 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRNPP04156 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRNPP04156 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRNPP04156 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms