Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFNB1P01574 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNB1P01574 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNB1P01574 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.7 ms