Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPP01282 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPP01282 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPP01282 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPP01282 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPP01282 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPP01282 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPP01282 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPP01282 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VIPP01282 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPP01282 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPP01282 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPP01282 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPP01282 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPP01282 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPP01282 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPP01282 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPP01282 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPP01282 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPP01282 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPP01282 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPP01282 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VIPP01282 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VIPP01282 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VIPP01282 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VIPP01282 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VIPP01282 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VIPP01282 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPP01282 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPP01282 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPP01282 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPP01282 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPP01282 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPP01282 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPP01282 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPP01282 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPP01282 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPP01282 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VIPP01282 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VIPP01282 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VIPP01282 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VIPP01282 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VIPP01282 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VIPP01282 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VIPP01282 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VIPP01282 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VIPP01282 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VIPP01282 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPP01282 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPP01282 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPP01282 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPP01282 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPP01282 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPP01282 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPP01282 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPP01282 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPP01282 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPP01282 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPP01282 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPP01282 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIPP01282 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPP01282 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPP01282 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPP01282 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPP01282 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPP01282 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPP01282 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPP01282 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPP01282 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPP01282 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIPP01282 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPP01282 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPP01282 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPP01282 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIPP01282 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPP01282 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPP01282 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPP01282 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPP01282 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPP01282 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPP01282 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPP01282 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VIPP01282 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms