Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED1O96006 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED1O96006 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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