Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C6orf47O95873 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf47O95873 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms