Protein–RNA interactions for Protein: O95793

STAU1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU1O95793 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAU1O95793 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAU1O95793 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAU1O95793 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAU1O95793 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAU1O95793 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STAU1O95793 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAU1O95793 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAU1O95793 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAU1O95793 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAU1O95793 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAU1O95793 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAU1O95793 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAU1O95793 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAU1O95793 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAU1O95793 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAU1O95793 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STAU1O95793 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAU1O95793 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAU1O95793 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAU1O95793 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAU1O95793 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAU1O95793 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAU1O95793 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAU1O95793 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAU1O95793 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STAU1O95793 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STAU1O95793 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STAU1O95793 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STAU1O95793 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STAU1O95793 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAU1O95793 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAU1O95793 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAU1O95793 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAU1O95793 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAU1O95793 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAU1O95793 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAU1O95793 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAU1O95793 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STAU1O95793 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAU1O95793 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAU1O95793 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAU1O95793 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAU1O95793 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STAU1O95793 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAU1O95793 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAU1O95793 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAU1O95793 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAU1O95793 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAU1O95793 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAU1O95793 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAU1O95793 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAU1O95793 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAU1O95793 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAU1O95793 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAU1O95793 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAU1O95793 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAU1O95793 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAU1O95793 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAU1O95793 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAU1O95793 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAU1O95793 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAU1O95793 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAU1O95793 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAU1O95793 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAU1O95793 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAU1O95793 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAU1O95793 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAU1O95793 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAU1O95793 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAU1O95793 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAU1O95793 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAU1O95793 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAU1O95793 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAU1O95793 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAU1O95793 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAU1O95793 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAU1O95793 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAU1O95793 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAU1O95793 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAU1O95793 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAU1O95793 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAU1O95793 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAU1O95793 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAU1O95793 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAU1O95793 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAU1O95793 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAU1O95793 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAU1O95793 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAU1O95793 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAU1O95793 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAU1O95793 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAU1O95793 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAU1O95793 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAU1O95793 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAU1O95793 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAU1O95793 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAU1O95793 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAU1O95793 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAU1O95793 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms