Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPO95166 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GABARAPO95166 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABARAPO95166 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms