Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB7O75200 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms