Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
N4BP1O75113 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP1O75113 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms