Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD6O60522 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD6O60522 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms