Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF3BA8MYP8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF3BA8MYP8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms