Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO3A2RU48 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms