Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB5Q9Y5E4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB5Q9Y5E4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.9 ms