Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD3Q9Y597 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms