Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FCF1Q9Y324 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FCF1Q9Y324 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms