Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms