Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRPC6Q9Y210 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC6Q9Y210 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms