Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGEF1Q9UJ41 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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