Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IRD1Q9UHL9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms