Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKIRAS2Q9NYR9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKIRAS2Q9NYR9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NKIRAS2Q9NYR9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKIRAS2Q9NYR9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms