Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COA4Q9NYJ1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COA4Q9NYJ1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 613.5 ms