Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NECAP2Q9NVZ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NECAP2Q9NVZ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms