Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA6CQ9H3T2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms