Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHACTR1Q9C0D0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms