Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms