Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG6Q9BXT2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG6Q9BXT2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG6Q9BXT2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms