Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-6Q9BXR3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-6Q9BXR3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-6Q9BXR3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-6Q9BXR3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-6Q9BXR3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-6Q9BXR3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-6Q9BXR3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-6Q9BXR3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms