Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CITED2Q99967 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CITED2Q99967 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms