Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD9AQ99638 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms