Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM12Q96EX1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms