Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPTQ96BT3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPTQ96BT3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPTQ96BT3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPTQ96BT3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPTQ96BT3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPTQ96BT3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPTQ96BT3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPTQ96BT3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPTQ96BT3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPTQ96BT3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPTQ96BT3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPTQ96BT3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPTQ96BT3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPTQ96BT3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPTQ96BT3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPTQ96BT3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms