Protein–RNA interactions for Protein: Q96B67

ARRDC3, Arrestin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3Q96B67 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC3Q96B67 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC3Q96B67 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC3Q96B67 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC3Q96B67 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC3Q96B67 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC3Q96B67 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC3Q96B67 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC3Q96B67 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC3Q96B67 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARRDC3Q96B67 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARRDC3Q96B67 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARRDC3Q96B67 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms