Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKD1Q969G9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKD1Q969G9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKD1Q969G9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms