Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG3L4Q8TBR4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms